Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21972J3QN38 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms