Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top6blJ3QMY9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top6blJ3QMY9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top6blJ3QMY9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Top6blJ3QMY9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top6blJ3QMY9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top6blJ3QMY9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top6blJ3QMY9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top6blJ3QMY9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Top6blJ3QMY9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Top6blJ3QMY9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top6blJ3QMY9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top6blJ3QMY9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top6blJ3QMY9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top6blJ3QMY9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top6blJ3QMY9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top6blJ3QMY9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top6blJ3QMY9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top6blJ3QMY9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Top6blJ3QMY9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top6blJ3QMY9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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