Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm3336J3QMQ6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3336J3QMQ6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3336J3QMQ6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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