Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21411J3KMS0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21411J3KMS0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21411J3KMS0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21411J3KMS0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21411J3KMS0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21411J3KMS0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21411J3KMS0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21411J3KMS0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21411J3KMS0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21411J3KMS0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21411J3KMS0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21411J3KMS0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21411J3KMS0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21411J3KMS0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21411J3KMS0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm21411J3KMS0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm21411J3KMS0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm21411J3KMS0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm21411J3KMS0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21411J3KMS0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21411J3KMS0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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