Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arfip1G5E8V9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfip1G5E8V9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfip1G5E8V9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfip1G5E8V9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfip1G5E8V9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfip1G5E8V9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfip1G5E8V9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfip1G5E8V9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfip1G5E8V9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfip1G5E8V9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfip1G5E8V9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfip1G5E8V9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfip1G5E8V9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfip1G5E8V9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfip1G5E8V9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfip1G5E8V9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 195.5 ms