Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Farp1F8VPU2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Farp1F8VPU2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms