Protein–RNA interactions for Protein: E9QAF4

Phldb3, Pleckstrin homology-like domain, family B, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phldb3E9QAF4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Phldb3E9QAF4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Phldb3E9QAF4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Phldb3E9QAF4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phldb3E9QAF4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phldb3E9QAF4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phldb3E9QAF4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phldb3E9QAF4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phldb3E9QAF4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phldb3E9QAF4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Phldb3E9QAF4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Phldb3E9QAF4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Phldb3E9QAF4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Phldb3E9QAF4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Phldb3E9QAF4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Phldb3E9QAF4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phldb3E9QAF4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phldb3E9QAF4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms