Protein–RNA interactions for Protein: E9QAA8

Gm4841, Interferon-gamma-inducible GTPase Ifgga3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4841E9QAA8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm4841E9QAA8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm4841E9QAA8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm4841E9QAA8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm4841E9QAA8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm4841E9QAA8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm4841E9QAA8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm4841E9QAA8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm4841E9QAA8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm4841E9QAA8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm4841E9QAA8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm4841E9QAA8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm4841E9QAA8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm4841E9QAA8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm4841E9QAA8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm4841E9QAA8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm4841E9QAA8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm4841E9QAA8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm4841E9QAA8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm4841E9QAA8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm4841E9QAA8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm4841E9QAA8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm4841E9QAA8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms