Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cald1E9QA15 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cald1E9QA15 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cald1E9QA15 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cald1E9QA15 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cald1E9QA15 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cald1E9QA15 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cald1E9QA15 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cald1E9QA15 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Cald1E9QA15 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cald1E9QA15 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cald1E9QA15 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cald1E9QA15 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cald1E9QA15 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cald1E9QA15 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cald1E9QA15 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cald1E9QA15 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cald1E9QA15 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Cald1E9QA15 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cald1E9QA15 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Cald1E9QA15 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cald1E9QA15 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cald1E9QA15 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cald1E9QA15 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cald1E9QA15 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cald1E9QA15 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cald1E9QA15 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cald1E9QA15 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cald1E9QA15 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cald1E9QA15 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cald1E9QA15 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cald1E9QA15 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cald1E9QA15 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Cald1E9QA15 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Cald1E9QA15 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cald1E9QA15 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cald1E9QA15 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cald1E9QA15 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cald1E9QA15 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cald1E9QA15 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cald1E9QA15 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cald1E9QA15 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cald1E9QA15 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cald1E9QA15 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms