Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
4930579F01RikE9Q3L6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930579F01RikE9Q3L6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930579F01RikE9Q3L6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930579F01RikE9Q3L6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930579F01RikE9Q3L6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930579F01RikE9Q3L6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930579F01RikE9Q3L6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930579F01RikE9Q3L6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930579F01RikE9Q3L6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms