Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
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Ccdc171E9Q1U1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
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Ccdc171E9Q1U1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc171E9Q1U1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc171E9Q1U1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
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