Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Srp54bE9PXC0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srp54bE9PXC0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srp54bE9PXC0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms