Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rpl3lE9PWZ3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rpl3lE9PWZ3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms