Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC6

4930558K02Rik, RIKEN cDNA 4930558K02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930558K02RikE0CXC6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930558K02RikE0CXC6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4930558K02RikE0CXC6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930558K02RikE0CXC6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms