Protein–RNA interactions for Protein: D3Z622

4930455H04Rik, MCG1045678, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930455H04RikD3Z622 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930455H04RikD3Z622 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930455H04RikD3Z622 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930455H04RikD3Z622 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930455H04RikD3Z622 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930455H04RikD3Z622 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930455H04RikD3Z622 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930455H04RikD3Z622 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930455H04RikD3Z622 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930455H04RikD3Z622 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930455H04RikD3Z622 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930455H04RikD3Z622 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
4930455H04RikD3Z622 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930455H04RikD3Z622 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930455H04RikD3Z622 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930455H04RikD3Z622 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930455H04RikD3Z622 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930455H04RikD3Z622 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930455H04RikD3Z622 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930455H04RikD3Z622 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930455H04RikD3Z622 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms