Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4D4

1700064H15Rik, RIKEN cDNA 1700064H15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700064H15RikD3Z4D4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700064H15RikD3Z4D4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
1700064H15RikD3Z4D4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700064H15RikD3Z4D4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700064H15RikD3Z4D4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700064H15RikD3Z4D4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700064H15RikD3Z4D4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700064H15RikD3Z4D4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700064H15RikD3Z4D4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700064H15RikD3Z4D4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700064H15RikD3Z4D4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700064H15RikD3Z4D4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
1700064H15RikD3Z4D4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
1700064H15RikD3Z4D4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700064H15RikD3Z4D4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700064H15RikD3Z4D4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700064H15RikD3Z4D4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700064H15RikD3Z4D4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700064H15RikD3Z4D4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700064H15RikD3Z4D4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700064H15RikD3Z4D4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700064H15RikD3Z4D4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700064H15RikD3Z4D4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
1700064H15RikD3Z4D4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700064H15RikD3Z4D4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700064H15RikD3Z4D4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700064H15RikD3Z4D4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700064H15RikD3Z4D4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700064H15RikD3Z4D4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms