Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0W7

Gm4871, MCG126741, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4871D3Z0W7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm4871D3Z0W7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm4871D3Z0W7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm4871D3Z0W7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm4871D3Z0W7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm4871D3Z0W7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm4871D3Z0W7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm4871D3Z0W7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm4871D3Z0W7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm4871D3Z0W7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm4871D3Z0W7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm4871D3Z0W7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm4871D3Z0W7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm4871D3Z0W7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm4871D3Z0W7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm4871D3Z0W7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm4871D3Z0W7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm4871D3Z0W7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm4871D3Z0W7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm4871D3Z0W7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm4871D3Z0W7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm4871D3Z0W7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm4871D3Z0W7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm4871D3Z0W7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm4871D3Z0W7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm4871D3Z0W7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm4871D3Z0W7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm4871D3Z0W7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms