Protein–RNA interactions for Protein: D3YWB7

Gm4297, Predicted gene 4297, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4297D3YWB7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm4297D3YWB7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm4297D3YWB7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms