Protein–RNA interactions for Protein: B5X0E4

Abcb5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb5B5X0E4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Abcb5B5X0E4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb5B5X0E4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms