Protein–RNA interactions for Protein: B1AVP0

Phactr2, Phosphatase and actin regulator, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr2B1AVP0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Phactr2B1AVP0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Phactr2B1AVP0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms