Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
4930435E12RikA6X8Z9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930435E12RikA6X8Z9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms