Protein–RNA interactions for Protein: A6X8J1

Gm16430, Predicted gene 16405, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16430A6X8J1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm16430A6X8J1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm16430A6X8J1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm16430A6X8J1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm16430A6X8J1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm16430A6X8J1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm16430A6X8J1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm16430A6X8J1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm16430A6X8J1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm16430A6X8J1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm16430A6X8J1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm16430A6X8J1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm16430A6X8J1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm16430A6X8J1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm16430A6X8J1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm16430A6X8J1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm16430A6X8J1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm16430A6X8J1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm16430A6X8J1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm16430A6X8J1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms