Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Palm3A2TJV2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Palm3A2TJV2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Palm3A2TJV2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Palm3A2TJV2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Palm3A2TJV2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Palm3A2TJV2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Palm3A2TJV2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Palm3A2TJV2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Palm3A2TJV2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Palm3A2TJV2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Palm3A2TJV2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Palm3A2TJV2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Palm3A2TJV2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Palm3A2TJV2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Palm3A2TJV2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Palm3A2TJV2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Palm3A2TJV2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Palm3A2TJV2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Palm3A2TJV2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Palm3A2TJV2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Palm3A2TJV2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Palm3A2TJV2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Palm3A2TJV2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms