Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Patl2A2ARM1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Patl2A2ARM1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Patl2A2ARM1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Patl2A2ARM1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Patl2A2ARM1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Patl2A2ARM1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Patl2A2ARM1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Patl2A2ARM1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Patl2A2ARM1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Patl2A2ARM1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Patl2A2ARM1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Patl2A2ARM1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Patl2A2ARM1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Patl2A2ARM1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Patl2A2ARM1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Patl2A2ARM1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Patl2A2ARM1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Patl2A2ARM1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Patl2A2ARM1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Patl2A2ARM1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Patl2A2ARM1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Patl2A2ARM1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms