Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CtcflA2APF3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtcflA2APF3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtcflA2APF3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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