Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GabreA2AMW3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GabreA2AMW3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms