Protein–RNA interactions for Protein: A2AJN7

Slc4a11, Sodium bicarbonate transporter-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a11A2AJN7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc4a11A2AJN7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc4a11A2AJN7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc4a11A2AJN7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc4a11A2AJN7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc4a11A2AJN7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc4a11A2AJN7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms