Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc183A2AJB1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc183A2AJB1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms