Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms