Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms