Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms