Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms