Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Pfdn1Q9CWM4 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfdn1Q9CWM4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
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