Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Depp1Q8K2F3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Depp1Q8K2F3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Depp1Q8K2F3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Depp1Q8K2F3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Depp1Q8K2F3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Depp1Q8K2F3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Depp1Q8K2F3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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