Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap100Q80VN0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms