Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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BcanQ61361 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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BcanQ61361 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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BcanQ61361 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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BcanQ61361 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BcanQ61361 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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BcanQ61361 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BcanQ61361 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms