Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms