Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms