Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms