Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hoxd13P70217 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hoxd13P70217 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hoxd13P70217 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hoxd13P70217 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hoxd13P70217 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hoxd13P70217 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Hoxd13P70217 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Hoxd13P70217 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Hoxd13P70217 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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