Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nub1P54729 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Nub1P54729 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nub1P54729 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nub1P54729 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nub1P54729 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nub1P54729 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nub1P54729 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nub1P54729 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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