Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Lbx1P52955 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Lbx1P52955 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Lbx1P52955 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Lbx1P52955 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Lbx1P52955 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lbx1P52955 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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