Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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PtpreP49446 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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PtpreP49446 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpreP49446 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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PtpreP49446 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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PtpreP49446 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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PtpreP49446 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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PtpreP49446 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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PtpreP49446 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PtpreP49446 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtpreP49446 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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