Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms