Protein–RNA interactions for Protein: P01801

Ig heavy chain V-III region J606, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01801 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01801 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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P01801 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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P01801 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P01801 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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