Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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