Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb3D3Z6J4 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms