Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc183A2AJB1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ccdc183A2AJB1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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