Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms