Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms